隔离制度是维护养殖环境安全和约束外来疫病入侵的有效保障，现代肉鸡的养殖周期在42-45天左右，在养殖过程中，有很多因素和可能性会由于隔离不力而让外来的疫病侵害和感染到鸡群。尽管我们讲“全进全出”很多年了，但是真正意义上的“全进全出”几乎还没有多少鸡场能做得到，即使有些相对严格的鸡场也只是局限在鸡群周转意义上的“全进全出”。之所以关注隔离制度和措施，关键是很多养鸡场在这一点上吃过大亏甚至栽过跟头。
（1）、在思想上一定要有养殖“全程独立”的概念，隔离从开始到结束，来不得半点马虎。
（2）、对外来人员的隔离，在养殖场周围除了必要的净道和污道的门口之外，要有能够阻挡人员和大的野生动物出入的篱笆等作为防护屏障。
（3）、减少养殖过程中的一切对外交往，每一次外出购物、残鸡处理、拉鸡粪、垫辅料等等都是有风险的。
（4）、必要的散装料车进入鸡场要经过严格的冲刷消毒，尤其是轮胎和底盘的消毒，司机原则上不允许随便下车。
（5）、在养殖过程中遇有特殊情况需要外出的如采购药物、疫苗、生活用品等，回来后要经过严格的更衣、沐浴消毒手续才能允许再次进入生产区，正常情况下可联系供应商送货上门。
（6）、在养殖区内定期灭鼠、灭蝇：在鸡舍通风窗上安装防止野鸟进入的铁丝网，必要的警卫用的家犬要拴养或圈养，不能到处乱跑，更不能喂食病死鸡。
（7）、饲养人员不能相互串舍，鸡舍门口必设消毒盆以供进入鸡舍的必要消毒之用。
（8）、鸡舍内日常所用的工具和用具要严格管理、配套使用，不能相互转借。
（9）、通过政府干预或依照《畜牧法》的相关规定禁止在鸡场周围2-4公里内发展同类养殖场或相关的养殖场（养猪场、养鸭场、蛋鸡养殖场）屠宰场等。
（10）、在养殖过程中应谢绝同行业组织的参观、考察和访问。一切观摩活动可安排在出栏过程中或出栏后进行，有条件的养殖场也可以设置并安装鸡舍内的监控系统。

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